各種臨床微生物之營養需求彼此不同，但所有微生物均須碳、氮素源及微量元素，培養基微實驗室供應微生物生長的物質；如已知培養基成分者，稱為合成培養基（chemically defined or synthetic medium）；而成分不完全知曉者，稱為非合成培養基（non-synthetic medium）。微生物檢驗所使用的培養基都屬於後者，除非特殊的實驗或研究項目才能使用合成培養基。某些微生物在簡單化學組成（僅含氮或硝酸鹽）之培養基即能生長，但另些需要培養基含有較複雜之蛋白質水解物－蛋白腖（peptone）作為氮素源才能生長。大多數臨床微生物須提供較複雜化合物才能生長良好。
培養基可依照其應用的目的或功能，分為下列數種：
一、滋養培養基（Enriched media）
培養基加入特殊養分如血液，血清或動植物抽出液體，而能提供挑剔性細菌的生長，如blood agar plate（BAP，血瓊脂平板）即為此類培養基，能支持Streptococcus pneumoniae（肺炎鏈球菌）的生長。又如Brucella agar（布魯氏菌瓊脂）（或AnBAP）能支持厭氧的生長，chocolate agar（巧克力瓊脂）能支持Haemophilus influenzae（流感嗜血桿菌）的生長。其它滋養培養基如tryptic soy agar（TSA，胰蛋白酶大豆瓊脂），tryptic soy broth（TSB，胰蛋白酶大豆肉湯），TGEA，plate count agar（PCA，平板計數瓊脂），nutrient agar（NA，營養瓊脂），LB agar，Mueller-Hinton（M-H）agar等。
二、選擇培養基（Selective media）
培養基加入某種特殊化學物質，能阻止一群（group）細菌的生長，但不影響另一群細菌的繁殖。例如eosin methylene blue medium（EMB，伊紅美藍培養基）及MacConkey medium（麥康凱培養基）能讓革蘭氏陰性桿菌〔如Escherichia coli（大腸桿菌）〕生長，但抑制革蘭氏陽性球菌（如葡萄球菌）。又如一些含抗生素的分離培養基（如CAN）能選擇性的抑制某些微生物（腸內菌）生長，但能讓特定微生物（葡萄球菌）生長良好。
三、區別培養基（Differential media）
培養基中含有某種特殊化學物質，使能在其生長的各種細菌顯出不同的特性，例如MceConkey medium（麥康凱培養基）生長的乳糖發酵性革蘭氏陰性桿菌呈粉紅色菌落，EMB agar呈深紫色或藍黑色，而乳糖非發酵性在兩者則呈無色菌落。事實上，MacConkey（麥康凱）及EMB agar除了作為區別性培養基外，亦是選擇性培養基，因革蘭氏陽性球菌不能在其上生長。又如不同種（species）的鏈球菌在BAP上呈現不同的溶血型式，因此BAP可區分溶血性和非溶血性細菌，所以BAP同時是滋養培養基，也是區別性培養基。
四、增數（菌）培養基（Enrichment media）
培養基中含特殊的成分適合所欲分離的菌種生長，而不適合他種細菌生長，增數培養基通常用於分離檢體所含各菌種中數目較少生長較慢的菌種，例如GN broth，Selenite brilliant green broth（亞硒酸鹽皇綠肉湯）用於糞便檢體的微生物檢查，能夠鼓勵Salmonella（沙門氏菌）（通常在病人檢體中數目僅佔少數，生長亦較常在菌慢）之生長而抑制常在菌如E.coil（大腸桿菌）之生長。又如alkaline peptone water（鹼性蛋白胨水）能讓霍亂弧菌生長而增加數目，而其它細菌在此高pH值的培養基則生長不佳。
五、鑑定細菌特性用培養基
碳水化合物發酵試驗培養基例如：bromocresol purple broth w/1% lactose（溴甲酚紫肉湯/1%乳糖），能測定微生物是否能發酵lactose（乳糖）（由紫色變黃色）及產色氣體〔Durham tube（杜蘭管）含氣泡〕。其它如CTA w/1% carbohydrate（碳水化合物），phenol red broth w/1% carbohydrate（酚紅肉湯/1% 碳水化合物），Andrade’s broth w/1% carbohydrate，O/F broth w/1% carbohydrate等。
- 基質利用試驗（Substrate utilization test）培養基
例如：Simmon citrate agar（檸檬酸鹽瓊脂）能決定細菌是否能利用citrate（檸檬酸鹽）為唯一碳素源（由綠色變藍色），又acetate agar（醋酸鹽瓊脂）能決定細菌是否能利用acetate（醋酸鹽）為唯一碳素源（由綠色變藍色）。
- 酵素生能力試驗（Enzyme-producing ability）培養基
例如：DNase試驗培養基能決定細菌是否能產生deoxyribonuclease（DNase，去氧核醣核酸酶），又如Christensen urea agar（克氏尿素瓊脂）能決定細菌是否能分泌urease（尿素酶）（由黃色變粉紅色），Qrnithine（烏氨酸）或Lysine decarboxylase medium（賴氨酸脫羧酶培養基）能測定是否產生此氨基酸酵素。
- 測定特殊代謝產物培養基
例如：methyl red（甲基紅）為測定細菌是否能發酵葡萄糖產生大量酸性代謝物（使培養基pH降至4.5以下）。又如VP培養基，為測定細菌是否能發酵葡萄糖產生代謝中間物acetylmethylcarbinol（acetoin，乙醯甲基甲醇）。
- 運動性試驗培養基
例如：motility test medium（運動性試驗培養基）穿刺接種細菌後，能根據在培養基生長括散的現象，決定該菌是否具有運動性。
- 產色素瓊脂（Chromogenic agar）
如針對各種病原菌的系列CHROMagar，不同微生物生長在培養基上時會顯現出其特殊的顏色。
文章擷取 : 實用臨床微生物診斷學(蔡文城博士 編著)
